若公司发行H股上市，那么由中外合资公司持有的本公司股份在发行后可以在港股流通吗？

只要公司股票在H股成功上市，持有该公司的股份的自然就上市了。只不过有锁定期。具体什么时候上市以上市公司公告为准。